MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica F92 chromosome

Total Repeats: 36860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019537	A	8	8	24	31	100 %	0 %	0 %	0 %	423049751
2	NC_019537	A	9	9	33	41	100 %	0 %	0 %	0 %	423049751
3	NC_019537	A	6	6	136	141	100 %	0 %	0 %	0 %	423049751
4	NC_019537	CAA	2	6	176	181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423049751
5	NC_019537	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049751
6	NC_019537	TAA	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049751
7	NC_019537	A	6	6	226	231	100 %	0 %	0 %	0 %	423049751
8	NC_019537	A	6	6	242	247	100 %	0 %	0 %	0 %	423049751
9	NC_019537	T	7	7	282	288	0 %	100 %	0 %	0 %	423049751
10	NC_019537	CAA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423049751
11	NC_019537	AGA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049751
12	NC_019537	AGT	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049751
13	NC_019537	AAG	2	6	358	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049751
14	NC_019537	TCA	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049751
15	NC_019537	AGA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049751
16	NC_019537	TGT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	423049751
17	NC_019537	AGC	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	423049751
18	NC_019537	TGG	2	6	585	590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	423049751
19	NC_019537	GCAA	2	8	618	625	50 %	0 %	25 %	25 %	423049751
20	NC_019537	ATT	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049751
21	NC_019537	TTA	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049751
22	NC_019537	CAAGAT	2	12	721	732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423049751
23	NC_019537	TGAT	2	8	770	777	25 %	50 %	25 %	0 %	423049751
24	NC_019537	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049751
25	NC_019537	A	6	6	994	999	100 %	0 %	0 %	0 %	423049751
26	NC_019537	CAG	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	423049751
27	NC_019537	GTAC	2	8	1057	1064	25 %	25 %	25 %	25 %	423049751
28	NC_019537	TAC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049751
29	NC_019537	CTA	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049751
30	NC_019537	GCTT	2	8	1153	1160	0 %	50 %	25 %	25 %	423049751
31	NC_019537	AAGAA	2	10	1181	1190	80 %	0 %	20 %	0 %	423049751
32	NC_019537	ATA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049751
33	NC_019537	GTT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	423049751
34	NC_019537	AAG	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049751
35	NC_019537	TGG	2	6	1359	1364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	423049751
36	NC_019537	ATGC	2	8	1384	1391	25 %	25 %	25 %	25 %	423049751
37	NC_019537	GAT	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049751
38	NC_019537	TAAA	2	8	1474	1481	75 %	25 %	0 %	0 %	423049751
39	NC_019537	A	6	6	1508	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	423049752
40	NC_019537	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049752
41	NC_019537	ATA	3	9	1625	1633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049752
42	NC_019537	AGTT	2	8	1686	1693	25 %	50 %	25 %	0 %	423049752
43	NC_019537	TGAT	2	8	1769	1776	25 %	50 %	25 %	0 %	423049752
44	NC_019537	TAA	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049752
45	NC_019537	AGCA	2	8	1883	1890	50 %	0 %	25 %	25 %	423049752
46	NC_019537	CAA	2	6	1906	1911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423049752
47	NC_019537	TCA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049752
48	NC_019537	TAT	2	6	1923	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049752
49	NC_019537	ATG	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049752
50	NC_019537	CTA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049752
51	NC_019537	A	7	7	2106	2112	100 %	0 %	0 %	0 %	423049752
52	NC_019537	AGA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049752
53	NC_019537	ATA	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049752
54	NC_019537	ATT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049752
55	NC_019537	TAA	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049752
56	NC_019537	GAA	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049752
57	NC_019537	TCTA	2	8	2527	2534	25 %	50 %	0 %	25 %	423049752
58	NC_019537	ATA	2	6	2579	2584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049752
59	NC_019537	GTTT	2	8	2585	2592	0 %	75 %	25 %	0 %	423049752
60	NC_019537	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049752
61	NC_019537	TAA	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049753
62	NC_019537	GAAT	2	8	2661	2668	50 %	25 %	25 %	0 %	423049753
63	NC_019537	A	7	7	2680	2686	100 %	0 %	0 %	0 %	423049753
64	NC_019537	TA	3	6	2703	2708	50 %	50 %	0 %	0 %	423049753
65	NC_019537	AGT	3	9	2733	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049753
66	NC_019537	TAA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049753
67	NC_019537	TATTTC	2	12	2819	2830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423049753
68	NC_019537	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	423049753
69	NC_019537	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	423049753
70	NC_019537	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049753
71	NC_019537	T	6	6	2929	2934	0 %	100 %	0 %	0 %	423049753
72	NC_019537	ATA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049753
73	NC_019537	T	6	6	2997	3002	0 %	100 %	0 %	0 %	423049753
74	NC_019537	ACC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	423049753
75	NC_019537	AT	3	6	3022	3027	50 %	50 %	0 %	0 %	423049753
76	NC_019537	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049753
77	NC_019537	TAT	2	6	3121	3126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049754
78	NC_019537	T	7	7	3142	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	423049754
79	NC_019537	ATA	2	6	3205	3210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049754
80	NC_019537	TAG	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049754
81	NC_019537	ATG	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049754
82	NC_019537	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423049754
83	NC_019537	CTT	3	9	3417	3425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	423049754
84	NC_019537	CATCT	2	10	3512	3521	20 %	40 %	0 %	40 %	423049754
85	NC_019537	TA	3	6	3563	3568	50 %	50 %	0 %	0 %	423049754
86	NC_019537	TTCTT	2	10	3584	3593	0 %	80 %	0 %	20 %	423049755
87	NC_019537	T	7	7	3612	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	423049755
88	NC_019537	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	423049755
89	NC_019537	CTT	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	423049755
90	NC_019537	GAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049755
91	NC_019537	TCAA	2	8	3734	3741	50 %	25 %	0 %	25 %	423049755
92	NC_019537	CAAC	2	8	3773	3780	50 %	0 %	0 %	50 %	423049755
93	NC_019537	CCTTG	2	10	3782	3791	0 %	40 %	20 %	40 %	423049755
94	NC_019537	AAC	2	6	3832	3837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423049755
95	NC_019537	A	6	6	3856	3861	100 %	0 %	0 %	0 %	423049755
96	NC_019537	CTT	2	6	3888	3893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	423049755
97	NC_019537	ATTA	2	8	3901	3908	50 %	50 %	0 %	0 %	423049755
98	NC_019537	ATG	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049755
99	NC_019537	GGT	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	423049756
100	NC_019537	TAC	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049756
101	NC_019537	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049756
102	NC_019537	GAT	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049756
103	NC_019537	TTA	2	6	4210	4215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049756
104	NC_019537	CAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423049756
105	NC_019537	GT	3	6	4252	4257	0 %	50 %	50 %	0 %	423049756
106	NC_019537	TGA	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049756
107	NC_019537	ATT	2	6	4307	4312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049756
108	NC_019537	TGTT	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	423049756
109	NC_019537	GGTA	2	8	4334	4341	25 %	25 %	50 %	0 %	423049756
110	NC_019537	AT	3	6	4373	4378	50 %	50 %	0 %	0 %	423049756
111	NC_019537	AAT	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049756
112	NC_019537	GGT	2	6	4518	4523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	423049756
113	NC_019537	T	6	6	4576	4581	0 %	100 %	0 %	0 %	423049756
114	NC_019537	TA	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	423049756
115	NC_019537	TAG	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049756
116	NC_019537	ATT	2	6	4704	4709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049757
117	NC_019537	GAA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	423049757
118	NC_019537	TA	4	8	4758	4765	50 %	50 %	0 %	0 %	423049757
119	NC_019537	CT	3	6	4779	4784	0 %	50 %	0 %	50 %	423049757
120	NC_019537	T	6	6	4788	4793	0 %	100 %	0 %	0 %	423049757
121	NC_019537	TTC	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	423049757
122	NC_019537	ATC	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049757
123	NC_019537	CAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049757
124	NC_019537	ATA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049757
125	NC_019537	ATTT	2	8	4974	4981	25 %	75 %	0 %	0 %	423049757
126	NC_019537	TGG	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	423049757
127	NC_019537	GCA	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	423049757
128	NC_019537	TTGA	2	8	5124	5131	25 %	50 %	25 %	0 %	423049757
129	NC_019537	ACA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	423049757
130	NC_019537	TA	3	6	5237	5242	50 %	50 %	0 %	0 %	423049757
131	NC_019537	TTTC	2	8	5261	5268	0 %	75 %	0 %	25 %	423049757
132	NC_019537	TAG	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049757
133	NC_019537	TAA	2	6	5337	5342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049757
134	NC_019537	AGT	2	6	5350	5355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049757
135	NC_019537	TTTA	2	8	5424	5431	25 %	75 %	0 %	0 %	423049757
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137	NC_019537	ATTA	2	8	5490	5497	50 %	50 %	0 %	0 %	423049757
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